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【NISA】確定申告は必要?原則不要な理由と例外ケースを徹底解説

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「NISA口座で利益が出たけど確定申告は必要?」「損が出たら税金は戻ってくる?」「配当金の受取方法で何か変わるの?」——NISAと確定申告の関係は、非課税制度であるがゆえに逆に誤解が多いテーマです。結論から言えば、NISA口座の利益(売却益・配当金・分配金)は非課税のため、確定申告は原則不要です。ただし、配当金の受取方法や損失の扱いなど、知らないと損をする例外・注意点がいくつかあります。本記事では、2024年からの新NISA制度をふまえ、確定申告が不要な理由から例外ケース、課税口座との違いまで、国税庁・金融庁の一次情報をもとに完全ガイドします。

📌 この記事でわかること

対象読者:NISA口座を利用中・利用予定の個人投資家/確定申告の要否を知りたい方/読了の目安:約10分

  • NISA口座の利益(売却益・配当金・分配金)が非課税・申告不要である理由
  • 確定申告が必要になる例外ケース(配当金の受取方式・損益通算・他の控除との関係)
  • NISA口座の損失が損益通算・繰越控除の対象外である注意点
  • 新NISA(2024年〜)の投資枠・非課税枠の復活ルールと、課税口座(特定口座)との違い
目次
ぜいむたん
NISA口座で投資信託が値上がりして売却しました。これって確定申告しないといけないんでしょうか…?
イザーク
結論から言うと、NISA口座の利益は非課税やから確定申告は原則いらんで。ただし配当金の受け取り方や、他の口座との組み合わせによっては申告が必要になるケースもある。順番に整理していこか!

NISAの基本と新NISA制度の概要(2024年〜)

ぜいむたん
2024年から新NISAになったと聞きましたが、何がどう変わったんですか?
イザーク
一番の変更点は非課税期間が無期限になったことと、投資枠が大幅に拡大したことやな。旧NISA(一般NISA・つみたてNISA)は2023年で新規の投資が終了して、2024年からは新NISAに一本化されたんや。

NISA(少額投資非課税制度)は、株式や投資信託の運用益にかかる税金が非課税になる制度です。通常、投資の利益には約20.315%(所得税15%+復興特別所得税0.315%+住民税5%)の税金がかかりますが、NISA口座での運用益はこの税金がかかりません。2024年からは「新NISA」に制度が一本化され、旧NISA(一般NISA・つみたてNISA)は2023年で新規の買付が終了しています(出典:金融庁 NISA特設ウェブサイト)。

新NISA(2024年〜)の3つの投資枠

①
つみたて投資枠

年間120万円まで。長期・積立・分散投資に適した投資信託が対象。

②
成長投資枠

年間240万円まで。上場株式・投資信託等が対象。つみたて投資枠と併用可能(合計年間最大360万円)。

③
生涯投資枠

1,800万円(うち成長投資枠は1,200万円まで)。非課税保有期間は無期限。

出典:金融庁 NISA特設ウェブサイトをもとに作成

項目旧NISA(〜2023年)新NISA(2024年〜)
非課税保有期間一般NISA:5年/つみたてNISA:20年無期限
年間投資枠一般NISA:120万円/つみたてNISA:40万円つみたて投資枠:120万円+成長投資枠:240万円
非課税保有限度額一般NISA:600万円/つみたてNISA:800万円1,800万円(うち成長投資枠は1,200万円まで)
制度の期限2023年で新規買付終了恒久化
枠の併用一般・つみたてはどちらか一方つみたて投資枠と成長投資枠を併用可能
旧NISAと新NISAの制度比較(出典:金融庁 NISA特設ウェブサイト)。旧NISAで保有中の商品は、新NISAへのロールオーバーはできず、それぞれの非課税期間満了まで別枠で保有が続きます。

NISA口座の利益が確定申告不要である理由

ぜいむたん
そもそも、なぜNISA口座の利益は確定申告がいらないんですか?普通の投資と何が違うんでしょう?
イザーク
確定申告の目的は「税金の精算」やけど、NISA口座はそもそも課税対象となる所得が発生せえへんから、精算する税金自体がないんや。特定口座(源泉徴収あり)みたいに証券会社が計算する必要もなく、投資家側で何もせんでええ仕組みになっとる。

NISA口座で得た利益は非課税所得であり、そもそも課税対象となる所得が発生しないため、確定申告書に記載する必要がありません。年末調整のみで済むサラリーマンの方はもちろん、個人事業主の方も、NISA口座内の取引については事業所得の確定申告書に記載不要です。

NISA口座で非課税になる3つの所得

①
売却益(譲渡益)

株式・投資信託を売却して得た利益。課税口座なら約20.315%の税金がかかるが、NISA口座は非課税。

②
配当金

株式から受け取る配当金。「株式数比例配分方式」を選んでいる場合に限り非課税。

③
分配金

投資信託から受け取る普通分配金。NISA口座内であれば非課税で受け取れる。

出典:国税庁 確定申告特集・金融庁 NISA特設ウェブサイトをもとに作成

非課税メリットを具体的な金額で見ると、投資信託で100万円の利益が出た場合、通常の課税口座では100万円×20.315%=約20.3万円の税金がかかりますが、NISA口座なら税金はゼロで100万円がまるごと手元に残ります。長期投資で利益が大きくなるほど、この差は拡大していきます。

確定申告が必要になる例外ケース

ぜいむたん
NISA口座は申告不要なのはわかりました。でも、どういう場合に例外的に申告が必要になるんですか?
イザーク
NISA口座そのものの取引で申告が必要になることは基本的にない。ただし、①配当金を株式数比例配分方式以外で受け取っている場合、②他の課税口座(一般口座・源泉徴収なしの特定口座)で申告が必要な所得がある場合は要注意やで。
状況確定申告
NISA口座内の売却益(譲渡益)不要
NISA口座の配当金(株式数比例配分方式で受取)不要
NISA口座の配当金を比例配分方式以外で受取その配当金は課税対象になり、申告した方が有利な場合がある
他の口座(一般口座・源泉徴収なしの特定口座)で年間利益20万円超必要
医療費控除・ふるさと納税など他の理由で確定申告する場合その申告にNISA口座の取引を記載する必要はない
NISA口座の確定申告要否の整理(出典:国税庁 確定申告特集)。医療費控除やふるさと納税で確定申告をする場合でも、NISA口座内の非課税取引は記載不要です。

なお、株式数比例配分方式以外(配当金領収証方式・登録配当金受領口座方式・個別銘柄指定方式)で受け取った配当金は源泉徴収された状態で入金されますが、そもそもNISA口座内で保有する株式の配当であっても、受取方式が比例配分方式でなければ課税扱いとなる点に注意が必要です。

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NISA口座の損失は損益通算・繰越控除の対象外

ぜいむたん
NISA口座で損失が出た場合、税金面で何か対策はできるんですか?
イザーク
実はこれがNISAの落とし穴なんや。NISA口座の損失は税務上「なかったこと」として扱われる。他の口座の利益と相殺(損益通算)することもできへんし、翌年に繰り越す(繰越控除)こともできへんねん。

課税口座(特定口座・一般口座)であれば、損失が出た年に確定申告をすることで、他の口座の利益と相殺する損益通算や、控除しきれなかった損失を翌年以降3年間繰り越す繰越控除が可能です。しかし、NISA口座は非課税制度であるため、そもそも税務上「損益」という概念自体が存在せず、これらの制度を一切利用できません(課税口座の損益通算・繰越控除については国税庁 No.1474 上場株式等に係る譲渡損失の損益通算及び繰越控除を参照)。

項目NISA口座特定口座(源泉徴収あり)
売却益への課税非課税約20.315%
配当金への課税非課税(比例配分方式のみ)約20.315%
損失の他口座との損益通算不可確定申告で可能
損失の繰越控除(3年間)不可確定申告で可能
確定申告原則不要原則不要(損益通算・繰越時のみ必要)
NISA口座と特定口座(源泉徴収あり)の税務上の違い。NISA口座は利益が出れば非課税というメリットがある一方、損失が出た場合のカバーができない点がデメリットです。
  • NISA口座は値上がりが期待できる商品向け:損失が出ても税務上のカバーがないため、長期保有で値上がりを狙う投資に向いている
  • 値動きの大きい商品は特定口座も検討:短期売買や値動きが激しい商品は、損失時に損益通算できる特定口座での運用も選択肢になる

配当金を非課税にする「株式数比例配分方式」

ぜいむたん
「株式数比例配分方式」って何ですか?配当金の受取方法で確定申告や課税が変わるんですか?
イザーク
ええ質問や!株式数比例配分方式は、証券口座を通じて配当金を受け取る方法のことやで。これを選んでおけば、NISA口座の配当金は非課税で確定申告も不要になる。逆に郵便局や銀行で受け取る方式やと、NISA口座で保有していても課税されてしまうんや。
配当金の受取方式NISA口座での課税
株式数比例配分方式(証券口座で受取)非課税
配当金領収証方式(郵便局等で受取)課税される
登録配当金受領口座方式(銀行口座で受取)課税される
個別銘柄指定方式課税される
配当金の受取方式とNISA口座での課税可否(出典:国税庁 No.1330 配当金を受け取ったとき(配当所得))。証券会社によってはデフォルトで比例配分方式になっていますが、必ず口座設定を確認しましょう。

配当金を株式数比例配分方式で受け取るには、証券会社での設定が必要です。設定方法が不明な場合は、口座を開設している証券会社のサポートセンターに確認するのが確実です。

NISA口座と課税口座(特定口座)の違い・使い分け

ぜいむたん
NISA口座と特定口座、どう使い分けたらいいですか?
イザーク
基本はNISA口座を最優先で使い切るのがセオリーや。年間投資枠(合計360万円)を超える分や、あえて損益通算したい商品を特定口座で保有する、という組み合わせが実務的やで。

NISA口座には年間投資枠(つみたて投資枠120万円+成長投資枠240万円)と生涯投資枠(1,800万円)の上限があります。この上限を超える投資や、あえて損失を計上して他の利益と相殺したい商品については、特定口座(源泉徴収あり)を併用するのが一般的です。

  • NISA口座:長期保有予定で値上がりが期待できる商品、非課税メリットを最大化したい商品向け
  • 特定口座(源泉徴収あり):NISA枠を使い切った後の追加投資、短期売買や値動きが大きい商品、損益通算をしたい商品向け

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外国株式の配当とNISAの注意点

ぜいむたん
NISA口座で米国株を持っているんですが、配当金にアメリカの税金が引かれています。これは取り戻せますか?
イザーク
それがNISAのもう一つの注意点なんや。外国株式の配当金には現地国の源泉税がかかるんやけど、課税口座なら確定申告で「外国税額控除」を使って一部取り戻せる。でもNISA口座はそもそも非課税扱いやから、外国税額控除の対象にならへんのや。

外国株式・海外ETFの配当金には、現地国での源泉税(例:米国株は10%)がかかります。課税口座であれば確定申告で「外国税額控除」を適用し、日本国内の税額から一部または全部を差し引くことができます(出典:国税庁 No.1240 居住者に係る外国税額控除)。しかし、NISA口座で受け取る外国株式の配当金は、この外国税額控除の対象外です。現地源泉税が引かれた金額がそのまま手取りとなる点に注意しましょう。

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新NISAの非課税枠復活制度(売却と再利用)

ぜいむたん
NISA口座で株を売却したら、その分の非課税枠は復活するんですか?
イザーク
新NISAでは売却した商品の取得額(簿価)分だけ、翌年に非課税枠が復活するんや!例えば100万円で買った株を150万円で売っても、復活するのは取得額の100万円分やで。年間投資枠の上限内での再利用にはなるけど、長期的に見たら大きなメリットや。

非課税枠復活の3つのポイント

①
復活するのは翌年

売却した年ではなく、翌年以降に非課税枠が復活する。

②
復活額は簿価ベース

復活するのは取得金額(簿価)分で、売却金額ではない。

③
年間枠の上限は不変

復活した枠も、その年の年間投資枠(最大360万円)の範囲内でしか使えない。

出典:金融庁 NISA特設ウェブサイトをもとに作成

例:成長投資枠で100万円の株式を購入し150万円で売却した場合内容
売却した年売却益50万円は非課税(申告不要)
翌年取得金額100万円分が非課税枠として復活
復活枠の利用翌年の成長投資枠(240万円)の範囲内で再利用可能
非課税枠復活のシミュレーション例(出典:金融庁 NISA特設ウェブサイトをもとに作成)。生涯投資枠1,800万円を使い切っても、売却により枠が復活すれば再投資が可能です。

例外的に確定申告する場合の手順

ぜいむたん
配当金を比例配分方式以外で受け取ってしまっていた場合、確定申告はどう進めればいいですか?
イザーク
大丈夫、必要な書類はそんなに多くない。証券会社や配当金の支払通知書を確認して、国税庁の作成コーナーで該当欄に入力していくだけや。手順を見ていこか。
STEP
金融機関から送付される書類を確認

特定口座年間取引報告書、配当金の支払通知書、NISA口座内の非課税適用確認書などが証券会社から送付されます。

STEP
NISA口座内の取引は記載不要と確認

NISA口座内で完結する売却益・配当金・分配金は確定申告書に記載する必要はありません。

STEP
比例配分方式以外の配当金はD欄に記入

株式数比例配分方式以外で受け取った配当金は、確定申告書第二表のD欄に記入し「非課税口座内上場株式等の配当等」にチェックします。

STEP
他の口座の取引・控除を合わせて入力

特定口座(源泉徴収なし)や一般口座の取引、医療費控除・ふるさと納税など他の控除がある場合は、あわせて該当欄に入力します。

STEP
申告書を確認しe-Taxまたは郵送で提出

内容を確認し、e-Taxで電子提出するか、印刷して税務署に郵送・持参します。申告期限は毎年2月16日から3月15日までです。

よくある質問(FAQ)

NISA口座と特定口座の両方で利益が出た場合、確定申告はどうなりますか?
NISA口座の利益は申告不要で、特定口座(源泉徴収あり)の利益も原則申告不要です。ただし、複数の証券会社の特定口座間で損益通算したい場合は確定申告が必要です。その際もNISA口座の利益は申告書に含めません。
旧NISA(2023年以前)で購入した商品はどうなりますか?
旧NISAで購入した商品は、それぞれの非課税期間(一般NISA:5年、つみたてNISA:20年)が終了するまで非課税で保有できます。新NISAへのロールオーバーはできず、非課税期間終了後は自動的に課税口座に移管されます。
医療費控除やふるさと納税で確定申告する場合、NISAの取引も記載が必要ですか?
いいえ、不要です。医療費控除やふるさと納税のために確定申告する場合でも、NISA口座内の取引については記載する必要はありません。
NISA口座で損失が出た場合、確定申告で他の所得と損益通算できますか?
いいえ、できません。NISA口座で生じた損失は、確定申告で他の所得や他の口座での利益と損益通算することはできません。これはNISA制度が「非課税」を前提としているため、損失についても税務上認識されないためです。
新NISAで非課税期間が無期限になりましたが、必ず永久に保有し続ける必要がありますか?
いいえ、必要ありません。新NISA制度でも、いつでも売却は可能で、売却時の利益は非課税です。売却した商品の取得金額(簿価)分だけ翌年に非課税枠が復活しますが、年間投資枠の上限の範囲内での再投資になります。
NISAの利益は住民税の申告や扶養の判定に影響しますか?
影響しません。NISA口座の利益は所得税だけでなく住民税も非課税で、住民税の申告も不要です。また、所得に含まれないため、配偶者控除・扶養控除の判定にも一切影響しません。

まとめ:NISAと確定申告のポイント

NISA口座は非課税制度であり、原則として確定申告は不要です。ただし、配当金の受取方法や損失の扱いなど、いくつかの注意点を押さえておく必要があります。最後に要点を整理します。

STEP
基本は確定申告不要

NISA口座の売却益・配当金・分配金はすべて非課税で、確定申告は必要ありません。

STEP
配当金は受取方法に注意

株式数比例配分方式で受け取れば非課税・申告不要、それ以外の方式では課税されます。

STEP
損失は税務上「なかったこと」になる

NISA口座内の損失は他の口座との損益通算や繰越控除の対象外です。

STEP
外国株式の配当は外国税額控除の対象外

NISA口座で受け取る外国株式の配当金は、現地源泉税があっても外国税額控除は使えません。

STEP
新NISAの非課税枠復活を活用する

売却した商品の取得金額(簿価)分だけ翌年に非課税枠が復活する制度を活用し、長期的な資産形成に役立てましょう。

イザーク
今日の授業は終わり!NISAの税金と確定申告について理解できたかな?わからへんことがあったらいつでも聞いてや!

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この記事を書いた人

イザーク|公認会計士試験合格者

Big4監査法人・税理士法人での実務経験と財務省での勤務経験を持ち、税務・会計の実務に精通。国税庁・財務省などの一次ソースに基づいて解説します。詳しい経歴はプロフィール・公認会計士試験受験記をご覧ください。

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本記事は執筆時点(2026年)の情報提供を目的としたものです。税制やサービスの内容は変更される場合があります。個別の税務判断は、税理士等の専門家にご確認ください(税理士法72条に留意)。
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